| Форма представления | Статьи в российских журналах и сборниках |
| Год публикации | 2018 |
| Язык | русский |
|
Абрамова Зинаида Ивановна, автор
Козлова Ольга Сергеевна, автор
|
| Библиографическое описание на языке оригинала |
Козлова О.С. Сборка генома ангидробиотического насекомого Polypedilum vanderplanki с использованием данных Illumina и Pacbio/Козлова О.С., Абрамова З.И. // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. – 2018. – Т. 160, кн. 2. – С. 214–226. |
| Аннотация |
В статье представлена новая версия сборки генома африканского ангидробиотического комара-звонца Polypedilum vanderplanki на основе глубокого секвенирования ДНК, выделенной из клеточной линии Pv11, полученной из эмбриональной массы насекомого. Исходными данными послужили парные прочтения с варьирующей длиной вставки, дополненные ультрадлинными прочтениями по технологии Pacific Biosciences. Показано, что результирующий набор скаффолдов обладает более высокими метриками целостности и полноты, кроме того, позволяет более корректно выполнять предсказание кодирующих последовательностей по сравнению с предыдущей версией сборки генома, что было продемонстрировано на примере белков теплового шока HSP20 и HSP70. |
| Ключевые слова |
Polypedilum vanderplanki, ангидробиоз, секвенирование ДНК, сборка генома |
| Название журнала |
Ученые записки Казанского государственного университета Серия: Естественные науки
|
| URL |
https://kpfu.ru/portal/docs/F_916691432/160_2_est_3.pdf |
| Пожалуйста, используйте этот идентификатор, чтобы цитировать или ссылаться на эту карточку |
https://repository.kpfu.ru/?p_id=186315 |
| Файлы ресурса | |
|
|
Полная запись метаданных  |
| Поле DC |
Значение |
Язык |
| dc.contributor.author |
Абрамова Зинаида Ивановна |
ru_RU |
| dc.contributor.author |
Козлова Ольга Сергеевна |
ru_RU |
| dc.date.accessioned |
2018-01-01T00:00:00Z |
ru_RU |
| dc.date.available |
2018-01-01T00:00:00Z |
ru_RU |
| dc.date.issued |
2018 |
ru_RU |
| dc.identifier.citation |
Козлова О.С. Сборка генома ангидробиотического насекомого Polypedilum vanderplanki с использованием данных Illumina и Pacbio/Козлова О.С., Абрамова З.И. // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. – 2018. – Т. 160, кн. 2. – С. 214–226. |
ru_RU |
| dc.identifier.uri |
https://repository.kpfu.ru/?p_id=186315 |
ru_RU |
| dc.description.abstract |
Ученые записки Казанского государственного университета Серия: Естественные науки |
ru_RU |
| dc.description.abstract |
В статье представлена новая версия сборки генома африканского ангидробиотического комара-звонца Polypedilum vanderplanki на основе глубокого секвенирования ДНК, выделенной из клеточной линии Pv11, полученной из эмбриональной массы насекомого. Исходными данными послужили парные прочтения с варьирующей длиной вставки, дополненные ультрадлинными прочтениями по технологии Pacific Biosciences. Показано, что результирующий набор скаффолдов обладает более высокими метриками целостности и полноты, кроме того, позволяет более корректно выполнять предсказание кодирующих последовательностей по сравнению с предыдущей версией сборки генома, что было продемонстрировано на примере белков теплового шока HSP20 и HSP70. |
ru_RU |
| dc.language.iso |
ru |
ru_RU |
| dc.subject |
Polypedilum vanderplanki |
ru_RU |
| dc.subject |
ангидробиоз |
ru_RU |
| dc.subject |
секвенирование ДНК |
ru_RU |
| dc.subject |
сборка генома |
ru_RU |
| dc.title |
Сборка генома ангидробиотического насекомого Polypedilum vanderplanki с использованием данных Illumina и Pacbio |
ru_RU |
| dc.type |
Статьи в российских журналах и сборниках |
ru_RU |
|
EN 
中文 
ES 
Карта сайта
