КФУ. Карточка публикации. Interfacial Interactions of Phosphatidylglycerol with Oligonucleotide DNA Revealed by Molecular Dynamics Method

КАЗАНСКИЙ
ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ

RUS

- EN
- 中文
- ES

INTERFACIAL INTERACTIONS OF PHOSPHATIDYLGLYCEROL WITH OLIGONUCLEOTIDE DNA REVEALED BY MOLECULAR DYNAMICS METHOD

Форма представления

Статьи в зарубежных журналах и сборниках

Год публикации

2022

Язык

английский

Авторы, сотрудники КФУ

Андрианов Григорий Васильевич, автор

Аюпов Рустам Хасанович, автор

Жданов Ренад Ибрагимович, автор

Ибрагимова Миляуша Якубовна, автор

Другие авторы

Зайцев Сергей Юрьевич, автор

Библиографическое описание на языке оригинала

Ibragimova M.Y. Interfacial Interactions of Phosphatidylglycerol with Oligonucleotide DNA Revealed by Molecular Dynamics Method / M.Y. Ibragimova, R.Kh. Aupov, G.V. Andrianov, R.I. Zhdanov , S.Yu. Zaitsev // Biointerface Research in Applied Chemistry. - 2022. - V. 12, Issue 3. - C. 3238 - 3246

Аннотация

Biointerface Research in Applied Chemistry

Ключевые слова

interfacial interactions; interatomic distances; phosphatidylglycerol; oligonucleotides; DNA-lipid complexes; docking; molecular dynamics

Название журнала

Biointerface Research in Applied Chemistry

Ссылка для РПД

http://dspace.kpfu.ru/xmlui/bitstream/handle/net/165869/F_20695837123.32383246.pdf?sequence=1&isAllowed=y

Пожалуйста, используйте этот идентификатор, чтобы цитировать или ссылаться на эту карточку

https://repository.kpfu.ru/?p_id=256655

Файлы ресурса

Название файла	Размер (Мб)	Формат
F_20695837123.32383246.pdf	0,59	pdf	посмотреть / скачать

Полная запись метаданных

Поле DC	Значение	Язык
dc.contributor.author	Андрианов Григорий Васильевич	ru_RU
dc.contributor.author	Аюпов Рустам Хасанович	ru_RU
dc.contributor.author	Жданов Ренад Ибрагимович	ru_RU
dc.contributor.author	Ибрагимова Миляуша Якубовна	ru_RU
dc.contributor.author	Зайцев Сергей Юрьевич	ru_RU
dc.date.accessioned	2022-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.available	2022-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.issued	2022	ru_RU
dc.identifier.citation	Ibragimova M.Y. Interfacial Interactions of Phosphatidylglycerol with Oligonucleotide DNA Revealed by Molecular Dynamics Method / M.Y. Ibragimova, R.Kh. Aupov, G.V. Andrianov, R.I. Zhdanov , S.Yu. Zaitsev // Biointerface Research in Applied Chemistry. - 2022. - V. 12, Issue 3. - C. 3238 - 3246	ru_RU
dc.identifier.uri	https://repository.kpfu.ru/?p_id=256655	ru_RU
dc.description.abstract	Biointerface Research in Applied Chemistry	ru_RU
dc.description.abstract	An interaction of DNA with lipids is of great interest because of their functions. As fatty acids and lipids can specifically bind to nucleic acids forming a code sequence of the genomic DNA, it is important to study the interaction of the oligonucleotide DNA (dA)20?(dT)20 with phosphatidylglycerol by the molecular dynamics method. Molecular docking has shown that these components form a stable complex with 5.8 kcal/mole binding energy, wherein the lipid is located in the DNA minor groove. This configuration marks 354 atom groups separated by a distance less than 3.4 Ǻ. The van der Waals and hydrophobic interactions play the leading part in the DNA-phospholipid complex stabilization along with hydrogen bonds.	ru_RU
dc.language.iso	ru	ru_RU
dc.subject		ru_RU
dc.title	Interfacial Interactions of Phosphatidylglycerol with Oligonucleotide DNA Revealed by Molecular Dynamics Method	ru_RU
dc.type	Статьи в зарубежных журналах и сборниках	ru_RU