КФУ. Карточка публикации. Использование высокопроизводительного секвенирования для изучения генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита в Уральском регионе Российской Федерации

RUS

- EN
- 中文
- ES

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА В УРАЛЬСКОМ РЕГИОНЕ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Форма представления

Статьи в российских журналах и сборниках

Год публикации

2024

Язык

русский

Авторы, сотрудники КФУ

Ткачев Сергей Евгеньевич, автор

Шагимарданова Елена Ильясовна, автор

Шайхутдинов Нурислам Маратович, автор

Шигапова Лейля Хуззатовна, автор

Другие авторы

Джиоев Юрий Павлович, автор

Дорощенко Елена Константиновна, автор

Злобин Владимир Игоревич, автор

Козлова Ирина Валерьевна, автор

Лисак Оксана Васильевна, автор

Сунцова Ольга Владимировна, автор

Якименко Валерий Викторович, автор

Библиографическое описание на языке оригинала

Шигапова Л.Х. Использование высокопроизводительного секвенирования для изучения генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита в Уральском регионе Российской Федерации / Л.Х. Шигапова, Н.М. Шайхутдинов, Е.И. Шагимарданова, И.В. Козлова, В.В. Якименко, О.В. Лисак, Е.К. Дорощенко, О.В. Сунцова, Ю.П. Джиоев, В.И. Злобин, С.Е. Ткачёв // Национальные приоритеты России. - 2024. - № 4 (55). – С. 84-89.

Аннотация

Вирус клещевого энцефалита (ВКЭ) является возбудителем тяжёлого заболевания центральной нервной системы человека — клещевого энцефалита. Высокопроизводительное полногеномное секвенирование вирусов является мощным инструментом для генетического анализа коллекций образцов штаммов ВКЭ. В настоящее время в базе данных GenBank содержится около 250 полногеномных последовательностей штаммов и изолятов ВКЭ из различных регионов Евразии, но для ряда регионов, включая Уральский регион, полногеномные после-довательности ВКЭ отсутствуют. Поэтому целью данного исследования являлось изучение генетического разно-образия ВКЭ в ряде районов Урала с использованием полногеномных последовательностей, полученных с помо-щью методов высокопроизводительного секвенирования. Молекулярно-генетический анализ 16 полногеномных последовательностей штаммов ВКЭ показал, что преобладающим субтипом среди исследуемых образцов ВКЭ оказались штаммы сибирского субтипа генетической линии Заусаев. Также в данном регионе были выявлены два штамма дальневосточного субтипа и впервые четыре штамма европейского субтипа. Полученные результаты позволят заполнить пробел

Ключевые слова

вирус клещевого энцефалита, субтип, генетическая линия, Уральский регион, высоко-производительное секвенирование

Название журнала

Национальные приоритеты России

Пожалуйста, используйте этот идентификатор, чтобы цитировать или ссылаться на эту карточку

https://repository.kpfu.ru/?p_id=306532

Файлы ресурса

Название файла	Размер (Мб)	Формат
F_Shigapova_i_dr.___2024___VKE_Ural.pdf	0,47	pdf	посмотреть / скачать

Полная запись метаданных

Поле DC	Значение	Язык
dc.contributor.author	Ткачев Сергей Евгеньевич	ru_RU
dc.contributor.author	Шагимарданова Елена Ильясовна	ru_RU
dc.contributor.author	Шайхутдинов Нурислам Маратович	ru_RU
dc.contributor.author	Шигапова Лейля Хуззатовна	ru_RU
dc.contributor.author	Джиоев Юрий Павлович	ru_RU
dc.contributor.author	Дорощенко Елена Константиновна	ru_RU
dc.contributor.author	Злобин Владимир Игоревич	ru_RU
dc.contributor.author	Козлова Ирина Валерьевна	ru_RU
dc.contributor.author	Лисак Оксана Васильевна	ru_RU
dc.contributor.author	Сунцова Ольга Владимировна	ru_RU
dc.contributor.author	Якименко Валерий Викторович	ru_RU
dc.date.accessioned	2024-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.available	2024-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.issued	2024	ru_RU
dc.identifier.citation	Шигапова Л.Х. Использование высокопроизводительного секвенирования для изучения генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита в Уральском регионе Российской Федерации / Л.Х. Шигапова, Н.М. Шайхутдинов, Е.И. Шагимарданова, И.В. Козлова, В.В. Якименко, О.В. Лисак, Е.К. Дорощенко, О.В. Сунцова, Ю.П. Джиоев, В.И. Злобин, С.Е. Ткачёв // Национальные приоритеты России. - 2024. - № 4 (55). – С. 84-89.	ru_RU
dc.identifier.uri	https://repository.kpfu.ru/?p_id=306532	ru_RU
dc.description.abstract	Национальные приоритеты России	ru_RU
dc.description.abstract	Вирус клещевого энцефалита (ВКЭ) является возбудителем тяжёлого заболевания центральной нервной системы человека — клещевого энцефалита. Высокопроизводительное полногеномное секвенирование вирусов является мощным инструментом для генетического анализа коллекций образцов штаммов ВКЭ. В настоящее время в базе данных GenBank содержится около 250 полногеномных последовательностей штаммов и изолятов ВКЭ из различных регионов Евразии, но для ряда регионов, включая Уральский регион, полногеномные после-довательности ВКЭ отсутствуют. Поэтому целью данного исследования являлось изучение генетического разно-образия ВКЭ в ряде районов Урала с использованием полногеномных последовательностей, полученных с помо-щью методов высокопроизводительного секвенирования. Молекулярно-генетический анализ 16 полногеномных последовательностей штаммов ВКЭ показал, что преобладающим субтипом среди исследуемых образцов ВКЭ оказались штаммы сибирского субтипа генетической линии Заусаев. Также в данном регионе были выявлены два штамма дальневосточного субтипа и впервые четыре штамма европейского субтипа. Полученные результаты позволят заполнить пробел	ru_RU
dc.language.iso	ru	ru_RU
dc.subject	вирус клещевого энцефалита	ru_RU
dc.subject	субтип	ru_RU
dc.subject	генетическая линия	ru_RU
dc.subject	Уральский регион	ru_RU
dc.subject	высоко-производительное секвенирование	ru_RU
dc.title	Использование высокопроизводительного секвенирования для изучения генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита в Уральском регионе Российской Федерации	ru_RU
dc.type	Статьи в российских журналах и сборниках	ru_RU