KFU. Card publication. Особенности комплексообразования ДНК с олеиновой кислотой по данным молекулярной динамики и спектров ЯМР

KAZAN
FEDERAL UNIVERSITY

- RUS
- 中文
- ES

ОСОБЕННОСТИ КОМПЛЕКСООБРАЗОВАНИЯ ДНК С ОЛЕИНОВОЙ КИСЛОТОЙ ПО ДАННЫМ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ И СПЕКТРОВ ЯМР

Form of presentation

Articles in Russian journals and collections

Year of publication

2014

Authors, employees of KFU

Ibragimova Milyausha Yakubovna, author

Izotova Ekaterina Dmitrievna, author

Tarasov Denis Stanislavovich, author

Bibliographic description in the original language

Zhdanov R.I., Tarasov D.S., Izotova E.D., Akberova N.I., Ibragimova M.Ya. Osobennosti kompleksoobrazovaniya DNK s oleinovoy kislotoy po dannym molekulyarnoy dinamiki i spektrov YaMR // Doklady Akad. Nauk (predstavleno akademikom A.R. Khokhlovym, v redakcii).

Annotation

Методом молекулярной динамики изучено взаимодействие олигонуклеотида ДНК (A)25?(T)25 с олеиновой кислотой (OLA) в нейтральной форме. Установлено, что данный комплекс отличается высокой конформационной подвижностью, где взаимодействующие части молекул постоянно изменяются в ходе динамики. Отрицательный заряд сахаро-фосфатного остова ДНК не является препятствием к образованию таких комплексов. Показано образование водородной связи между олеиновой кислотой и пиримидиновым кольцом: водород карбоксильной группы олеиновой кислоты (OLA41:H4) в ходе оптимизации подходит ближе к ДНК и образует водородную связь с азотом (dA10:N3) пуринового основания. Длина водородной связи dA10:N3 - OLA41:H4 составляет 1.82 Å. Образование водородной связи с азотистым основанием может теоретически влиять на стабильность дуплекса и обуславливать сиквенс-специфичное взаимодействие ДНК и жирных кислот.

Keywords

Олигонуклеотиды ДНК, олеиновая кислота, ДНК-липидные взаимодействия, молекулярная динамика, межатомные расстояния.

The name of the journal

Доклады академии наук

Please use this ID to quote from or refer to the card

https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=97303&p_lang=2

Full metadata record

Field DC	Value	Language
dc.contributor.author	Ibragimova Milyausha Yakubovna	ru_RU
dc.contributor.author	Izotova Ekaterina Dmitrievna	ru_RU
dc.contributor.author	Tarasov Denis Stanislavovich	ru_RU
dc.date.accessioned	2014-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.available	2014-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.issued	2014	ru_RU
dc.identifier.citation	Жданов Р.И., Тарасов Д.С., Изотова Е.Д., Акберова Н.И., Ибрагимова М.Я. Особенности комплексообразования ДНК с олеиновой кислотой по данным молекулярной динамики и спектров ЯМР // Доклады Акад. Наук (представлено академиком А.Р. Хохловым, в редакции).	ru_RU
dc.identifier.uri	https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=97303&p_lang=2	ru_RU
dc.description.abstract	Доклады академии наук	ru_RU
dc.description.abstract	Методом молекулярной динамики изучено взаимодействие олигонуклеотида ДНК (A)25?(T)25 с олеиновой кислотой (OLA) в нейтральной форме. Установлено, что данный комплекс отличается высокой конформационной подвижностью, где взаимодействующие части молекул постоянно изменяются в ходе динамики. Отрицательный заряд сахаро-фосфатного остова ДНК не является препятствием к образованию таких комплексов. Показано образование водородной связи между олеиновой кислотой и пиримидиновым кольцом: водород карбоксильной группы олеиновой кислоты (OLA41:H4) в ходе оптимизации подходит ближе к ДНК и образует водородную связь с азотом (dA10:N3) пуринового основания. Длина водородной связи dA10:N3 - OLA41:H4 составляет 1.82 Å. Образование водородной связи с азотистым основанием может теоретически влиять на стабильность дуплекса и обуславливать сиквенс-специфичное взаимодействие ДНК и жирных кислот.	ru_RU
dc.language.iso	ru	ru_RU
dc.subject	Олигонуклеотиды ДНК	ru_RU
dc.subject	олеиновая кислота	ru_RU
dc.subject	ДНК-липидные взаимодействия	ru_RU
dc.subject	молекулярная динамика	ru_RU
dc.subject	межатомные расстояния.	ru_RU
dc.title	Особенности комплексообразования ДНК с олеиновой кислотой по данным молекулярной динамики и спектров ЯМР	ru_RU
dc.type	Articles in Russian journals and collections	ru_RU