КФУ. Карточка публикации. GPAMM − ПРОГРАММНЫЙ ПАКЕТ ДЛЯ РАСЧЕТОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА ГРАФИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОРАХ

КАЗАНСКИЙ
ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ

RUS

- EN
- 中文
- ES

GPAMM − ПРОГРАММНЫЙ ПАКЕТ ДЛЯ РАСЧЕТОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА ГРАФИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОРАХ

Форма представления

Статьи в российских журналах и сборниках

Год публикации

2009

Язык

русский

Авторы, сотрудники КФУ

Изотова Екатерина Дмитриевна, автор

Библиографическое описание на языке оригинала

Тарасов Д.C. GPAMM − ПРОГРАММНЫЙ ПАКЕТ ДЛЯ РАСЧЕТОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА ГРАФИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОРАХ/ Е.Д. Изотова, Д.А. Алишева, Н.И. Акберова//МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ 2009 год, том 21, номер 3, c. 31-40

Аннотация

Представлен программный пакет и рассмотрены соответствующие алгоритмы для расчетов молеку- лярной динамики на графических процессорах (GPU) NVIDIA G80,G84,G92 с использованием тех- нологии NVIDIA CUDA. Реализованы потенциалы MM2 и AMBER с возможностью комбинации функций для создания других потенциалов. Поддерживается расчет молекулярной динамики в ус- ловиях NVT (канонический ансамбль) и NVE (микроканонический ансамбль). Сравнивается произ- водительность кода для различных графических процессоров с производительностью МД-алгорит- мов для процессоров Intel Celeron, Intel Pentium 4 и Intel Core2 Duo. Показано, что прирост произво- дительности составляет до 30 раз. Программный пакет доступен по адресу www.gpamm.mntech.ru

Ключевые слова

молекулярная динамика, графический процессор

Название журнала

Математическое моделирование

Пожалуйста, используйте этот идентификатор, чтобы цитировать или ссылаться на эту карточку

https://repository.kpfu.ru/?p_id=124877

Файлы ресурса

Название файла	Размер (Мб)	Формат
mm2745_2009_gpamp_mat_model.pdf	0,38	pdf	посмотреть / скачать

Полная запись метаданных

Поле DC	Значение	Язык
dc.contributor.author	Изотова Екатерина Дмитриевна	ru_RU
dc.date.accessioned	2009-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.available	2009-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.issued	2009	ru_RU
dc.identifier.citation	Тарасов Д.C. GPAMM − ПРОГРАММНЫЙ ПАКЕТ ДЛЯ РАСЧЕТОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА ГРАФИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОРАХ/ Е.Д. Изотова, Д.А. Алишева, Н.И. Акберова//МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ 2009 год, том 21, номер 3, c. 31-40	ru_RU
dc.identifier.uri	https://repository.kpfu.ru/?p_id=124877	ru_RU
dc.description.abstract	Математическое моделирование	ru_RU
dc.description.abstract	Представлен программный пакет и рассмотрены соответствующие алгоритмы для расчетов молеку- лярной динамики на графических процессорах (GPU) NVIDIA G80,G84,G92 с использованием тех- нологии NVIDIA CUDA. Реализованы потенциалы MM2 и AMBER с возможностью комбинации функций для создания других потенциалов. Поддерживается расчет молекулярной динамики в ус- ловиях NVT (канонический ансамбль) и NVE (микроканонический ансамбль). Сравнивается произ- водительность кода для различных графических процессоров с производительностью МД-алгорит- мов для процессоров Intel Celeron, Intel Pentium 4 и Intel Core2 Duo. Показано, что прирост произво- дительности составляет до 30 раз. Программный пакет доступен по адресу www.gpamm.mntech.ru	ru_RU
dc.language.iso	ru	ru_RU
dc.subject	молекулярная динамика	ru_RU
dc.subject	графический процессор	ru_RU
dc.title	GPAMM − ПРОГРАММНЫЙ ПАКЕТ ДЛЯ РАСЧЕТОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА ГРАФИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОРАХ	ru_RU
dc.type	Статьи в российских журналах и сборниках	ru_RU