Форма представления | Статьи в российских журналах и сборниках |
Год публикации | 2015 |
Язык | русский |
|
Каюмов Айрат Рашитович, автор
|
|
Борхсениус С. Н., автор
Вишняков И. Е., автор
Ривкина Е. М., автор
Шмакова Л. А., автор
|
Библиографическое описание на языке оригинала |
Вишняков И.Е. ДНК «минимальных» клеток (микоплазм) в метагеномах вечной мерзлоты / Вишняков И.Е., Борхсениус С.Н., Каюмов А.Р., Шмакова Л.А., Ривкина Е.М. // Гены & Клетки. - 2015. - Том X, №3. - С.12-21. |
Аннотация |
В вечной мерзлоте в течение длительного геологического времени могут сохраняться ферменты, нуклеиновые кислоты, вирусы и жизнеспособные микроорганизмы. Сложно получить целостное представление о микробном сообществе многолетнемерзлых толщ, используя только классические микробиологические методы. Анализ метагеномов вечной мерзлоты позволил обнаружить генетический материал древних микоплазм – патогенов человека, животных и растений. Отбор образцов, выделение тотальной ДНК из почвы, секвенирование (Illumina), обработка метагеномных данных (MG-RAST, M5nr, UniProt, Krona). Предсказан видовой состав микоплазм в почвенных образцах многолетнемерзлых отложений Арктики различного происхождения, но сопоставимого возраста (31–32 тыс. лет). Выполнен сравнительный анализ коротких полипептидов, кодируемых фрагментами древней ДНК, с участками белков современных микоплазм. Обсуждаются филогенетическая история Mollicutes, пластичность их генома и патогенный потенциал вечной мерзлоты. |
Ключевые слова |
микоплазмы, метагеномы, вечная мерзлота, пластичность генома, патогенный потенциал, "минимальная" клетка |
Название журнала |
Гены & клетки
|
Пожалуйста, используйте этот идентификатор, чтобы цитировать или ссылаться на эту карточку |
https://repository.kpfu.ru/?p_id=138699 |
Полная запись метаданных |
Поле DC |
Значение |
Язык |
dc.contributor.author |
Каюмов Айрат Рашитович |
ru_RU |
dc.contributor.author |
Борхсениус С. Н. |
ru_RU |
dc.contributor.author |
Вишняков И. Е. |
ru_RU |
dc.contributor.author |
Ривкина Е. М. |
ru_RU |
dc.contributor.author |
Шмакова Л. А. |
ru_RU |
dc.date.accessioned |
2015-01-01T00:00:00Z |
ru_RU |
dc.date.available |
2015-01-01T00:00:00Z |
ru_RU |
dc.date.issued |
2015 |
ru_RU |
dc.identifier.citation |
Вишняков И.Е. ДНК «минимальных» клеток (микоплазм) в метагеномах вечной мерзлоты / Вишняков И.Е., Борхсениус С.Н., Каюмов А.Р., Шмакова Л.А., Ривкина Е.М. // Гены & Клетки. - 2015. - Том X, №3. - С.12-21. |
ru_RU |
dc.identifier.uri |
https://repository.kpfu.ru/?p_id=138699 |
ru_RU |
dc.description.abstract |
Гены & клетки |
ru_RU |
dc.description.abstract |
В вечной мерзлоте в течение длительного геологического времени могут сохраняться ферменты, нуклеиновые кислоты, вирусы и жизнеспособные микроорганизмы. Сложно получить целостное представление о микробном сообществе многолетнемерзлых толщ, используя только классические микробиологические методы. Анализ метагеномов вечной мерзлоты позволил обнаружить генетический материал древних микоплазм – патогенов человека, животных и растений. Отбор образцов, выделение тотальной ДНК из почвы, секвенирование (Illumina), обработка метагеномных данных (MG-RAST, M5nr, UniProt, Krona). Предсказан видовой состав микоплазм в почвенных образцах многолетнемерзлых отложений Арктики различного происхождения, но сопоставимого возраста (31–32 тыс. лет). Выполнен сравнительный анализ коротких полипептидов, кодируемых фрагментами древней ДНК, с участками белков современных микоплазм. Обсуждаются филогенетическая история Mollicutes, пластичность их генома и патогенный потенциал вечной мерзлоты. |
ru_RU |
dc.language.iso |
ru |
ru_RU |
dc.subject |
микоплазмы |
ru_RU |
dc.subject |
метагеномы |
ru_RU |
dc.subject |
вечная мерзлота |
ru_RU |
dc.subject |
пластичность генома |
ru_RU |
dc.subject |
патогенный потенциал |
ru_RU |
dc.subject |
"минимальная" клетка |
ru_RU |
dc.title |
ДНК «минимальных» клеток (микоплазм) в метагеномах вечной мерзлоты |
ru_RU |
dc.type |
Статьи в российских журналах и сборниках |
ru_RU |
|