Форма представления | Тезисы и материалы конференций в российских журналах и сборниках |
Год публикации | 2018 |
Язык | русский |
|
Акберова Наталья Ивановна, автор
Козлова Анастасия Сергеевна, автор
|
|
Козлова Анастасия Сергеевна, автор
|
|
Козлова Анастасия Сергеевна, автор
|
Библиографическое описание на языке оригинала |
Козлова А. С., Акберова Н. И. Предсказание структуры транспортера NaPi2b. Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул, Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod2018 (Hовосибирск, 28-30 апреля 2018 г.) / Новосиб. гос. Ун-т. -Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2018. - 52с |
Аннотация |
Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул, Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod2018 (Hовосибирск, 28-30 апреля 2018 г.) |
Ключевые слова |
фосфатный транспортер, de novo предсказание пространственной структуры белка |
Название журнала |
Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул, Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod2018 (Hовосибирск, 28-30 апреля 2018 г.)
|
Пожалуйста, используйте этот идентификатор, чтобы цитировать или ссылаться на эту карточку |
https://repository.kpfu.ru/?p_id=186314 |
Полная запись метаданных |
Поле DC |
Значение |
Язык |
dc.contributor.author |
Акберова Наталья Ивановна |
ru_RU |
dc.contributor.author |
Козлова Анастасия Сергеевна |
ru_RU |
dc.contributor.author |
Козлова Анастасия Сергеевна |
ru_RU |
dc.contributor.author |
Козлова Анастасия Сергеевна |
ru_RU |
dc.date.accessioned |
2018-01-01T00:00:00Z |
ru_RU |
dc.date.available |
2018-01-01T00:00:00Z |
ru_RU |
dc.date.issued |
2018 |
ru_RU |
dc.identifier.citation |
Козлова А. С., Акберова Н. И. Предсказание структуры транспортера NaPi2b. Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул, Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod2018 (Hовосибирск, 28-30 апреля 2018 г.) / Новосиб. гос. Ун-т. -Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2018. - 52с |
ru_RU |
dc.identifier.uri |
https://repository.kpfu.ru/?p_id=186314 |
ru_RU |
dc.description.abstract |
Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул, Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod2018 (Hовосибирск, 28-30 апреля 2018 г.) |
ru_RU |
dc.description.abstract |
Целью работы было предсказание пространственной структуры транспортера NaPi2b по его аминокислотной последовательности с использованием биоин-форматических подходов.
Для построения топологии NaPi2b использовали базу данных Uniprot и про-грамму CCTOP. Для предсказания трехмерной структуры использовали подход de novo с помощью программ QUARKи Robetta. Качество полученных моделей оценивали с помощью программы Qmean.
Было показано, что NaPi2b имеет 8 трансмембранных участков, четыре внекле-точных домена, С- и N-концы, расположенные в цитоплазме. Для предсказания трехмерной структуры, белковая последовательность транспортера была поде-лена на 17 участков c учетом топологии NaPi2b. Для дальнейшего построения модели были выбраны структуры участков с наибольшим значением Qmean для увеличения точности предсказания структуры. В участках 1-100, 234-362, 574-690, были совершены повороты между следующими аминокислотами 40-41, 58-59, 320-321, 340-341, 579-580 для приведения в соответствие с предсказ |
ru_RU |
dc.language.iso |
ru |
ru_RU |
dc.subject |
фосфатный транспортер |
ru_RU |
dc.subject |
de novo предсказание пространственной структуры белка |
ru_RU |
dc.title |
Предсказание структуры транспортера NaPi2b |
ru_RU |
dc.type |
Тезисы и материалы конференций в российских журналах и сборниках |
ru_RU |
|