Форма представления | Статьи в российских журналах и сборниках |
Год публикации | 2014 |
|
Ибрагимова Миляуша Якубовна, автор
Изотова Екатерина Дмитриевна, автор
Тарасов Денис Станиславович, автор
|
Библиографическое описание на языке оригинала |
Жданов Р.И., Тарасов Д.С., Изотова Е.Д., Акберова Н.И., Ибрагимова М.Я. Особенности комплексообразования ДНК с олеиновой кислотой по данным молекулярной динамики и спектров ЯМР // Доклады Акад. Наук (представлено академиком А.Р. Хохловым, в редакции). |
Аннотация |
Методом молекулярной динамики изучено взаимодействие олигонуклеотида ДНК (A)25?(T)25 с олеиновой кислотой (OLA) в нейтральной форме. Установлено, что данный комплекс отличается высокой конформационной подвижностью, где взаимодействующие части молекул постоянно изменяются в ходе динамики. Отрицательный заряд сахаро-фосфатного остова ДНК не является препятствием к образованию таких комплексов. Показано образование водородной связи между олеиновой кислотой и пиримидиновым кольцом: водород карбоксильной группы олеиновой кислоты (OLA41:H4) в ходе оптимизации подходит ближе к ДНК и образует водородную связь с азотом (dA10:N3) пуринового основания. Длина водородной связи dA10:N3 - OLA41:H4 составляет 1.82 Å. Образование водородной связи с азотистым основанием может теоретически влиять на стабильность дуплекса и обуславливать сиквенс-специфичное взаимодействие ДНК и жирных кислот. |
Ключевые слова |
Олигонуклеотиды ДНК, олеиновая кислота, ДНК-липидные взаимодействия, молекулярная динамика, межатомные расстояния. |
Название журнала |
Доклады академии наук
|
Пожалуйста, используйте этот идентификатор, чтобы цитировать или ссылаться на эту карточку |
https://repository.kpfu.ru/?p_id=97303 |
Полная запись метаданных |
Поле DC |
Значение |
Язык |
dc.contributor.author |
Ибрагимова Миляуша Якубовна |
ru_RU |
dc.contributor.author |
Изотова Екатерина Дмитриевна |
ru_RU |
dc.contributor.author |
Тарасов Денис Станиславович |
ru_RU |
dc.date.accessioned |
2014-01-01T00:00:00Z |
ru_RU |
dc.date.available |
2014-01-01T00:00:00Z |
ru_RU |
dc.date.issued |
2014 |
ru_RU |
dc.identifier.citation |
Жданов Р.И., Тарасов Д.С., Изотова Е.Д., Акберова Н.И., Ибрагимова М.Я. Особенности комплексообразования ДНК с олеиновой кислотой по данным молекулярной динамики и спектров ЯМР // Доклады Акад. Наук (представлено академиком А.Р. Хохловым, в редакции). |
ru_RU |
dc.identifier.uri |
https://repository.kpfu.ru/?p_id=97303 |
ru_RU |
dc.description.abstract |
Доклады академии наук |
ru_RU |
dc.description.abstract |
Методом молекулярной динамики изучено взаимодействие олигонуклеотида ДНК (A)25?(T)25 с олеиновой кислотой (OLA) в нейтральной форме. Установлено, что данный комплекс отличается высокой конформационной подвижностью, где взаимодействующие части молекул постоянно изменяются в ходе динамики. Отрицательный заряд сахаро-фосфатного остова ДНК не является препятствием к образованию таких комплексов. Показано образование водородной связи между олеиновой кислотой и пиримидиновым кольцом: водород карбоксильной группы олеиновой кислоты (OLA41:H4) в ходе оптимизации подходит ближе к ДНК и образует водородную связь с азотом (dA10:N3) пуринового основания. Длина водородной связи dA10:N3 - OLA41:H4 составляет 1.82 Å. Образование водородной связи с азотистым основанием может теоретически влиять на стабильность дуплекса и обуславливать сиквенс-специфичное взаимодействие ДНК и жирных кислот. |
ru_RU |
dc.language.iso |
ru |
ru_RU |
dc.subject |
Олигонуклеотиды ДНК |
ru_RU |
dc.subject |
олеиновая кислота |
ru_RU |
dc.subject |
ДНК-липидные взаимодействия |
ru_RU |
dc.subject |
молекулярная динамика |
ru_RU |
dc.subject |
межатомные расстояния. |
ru_RU |
dc.title |
Особенности комплексообразования ДНК с олеиновой кислотой по данным молекулярной динамики и спектров ЯМР |
ru_RU |
dc.type |
Статьи в российских журналах и сборниках |
ru_RU |
|