Казанский (Приволжский) федеральный университет, КФУ
КАЗАНСКИЙ
ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ
 
RSS Ins Вконтакте twitter facebook
ОСОБЕННОСТИ КОМПЛЕКСООБРАЗОВАНИЯ ДНК С ОЛЕИНОВОЙ КИСЛОТОЙ ПО ДАННЫМ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ И СПЕКТРОВ ЯМР
Форма представленияСтатьи в российских журналах и сборниках
Год публикации2014
  • Ибрагимова Миляуша Якубовна, автор
  • Изотова Екатерина Дмитриевна, автор
  • Тарасов Денис Станиславович, автор
  • Библиографическое описание на языке оригинала Жданов Р.И., Тарасов Д.С., Изотова Е.Д., Акберова Н.И., Ибрагимова М.Я. Особенности комплексообразования ДНК с олеиновой кислотой по данным молекулярной динамики и спектров ЯМР // Доклады Акад. Наук (представлено академиком А.Р. Хохловым, в редакции).
    Аннотация Методом молекулярной динамики изучено взаимодействие олигонуклеотида ДНК (A)25?(T)25 с олеиновой кислотой (OLA) в нейтральной форме. Установлено, что данный комплекс отличается высокой конформационной подвижностью, где взаимодействующие части молекул постоянно изменяются в ходе динамики. Отрицательный заряд сахаро-фосфатного остова ДНК не является препятствием к образованию таких комплексов. Показано образование водородной связи между олеиновой кислотой и пиримидиновым кольцом: водород карбоксильной группы олеиновой кислоты (OLA41:H4) в ходе оптимизации подходит ближе к ДНК и образует водородную связь с азотом (dA10:N3) пуринового основания. Длина водородной связи dA10:N3 - OLA41:H4 составляет 1.82 Å. Образование водородной связи с азотистым основанием может теоретически влиять на стабильность дуплекса и обуславливать сиквенс-специфичное взаимодействие ДНК и жирных кислот.
    Ключевые слова Олигонуклеотиды ДНК, олеиновая кислота, ДНК-липидные взаимодействия, молекулярная динамика, межатомные расстояния.
    Название журнала Доклады академии наук
    Пожалуйста, используйте этот идентификатор, чтобы цитировать или ссылаться на эту карточку https://repository.kpfu.ru/?p_id=97303

    Полная запись метаданных