KFU. Card publication. ДНК «минимальных» клеток (микоплазм) в метагеномах вечной мерзлоты

KAZAN
FEDERAL UNIVERSITY

- RUS
- 中文
- ES

ДНК &LAQUO;МИНИМАЛЬНЫХ&RAQUO; КЛЕТОК (МИКОПЛАЗМ) В МЕТАГЕНОМАХ ВЕЧНОЙ МЕРЗЛОТЫ

Form of presentation

Articles in Russian journals and collections

Year of publication

2015

Язык

русский

Authors, employees of KFU

Kayumov Ayrat Rashitovich, author

Other authors

Borkhsenius S. N., author

Vishnyakov I. E., author

Rivkina E. M., author

Shmakova L. A., author

Bibliographic description in the original language

Vishnyakov I.E. DNK «minimalnykh» kletok (mikoplazm) v metagenomakh vechnoy merzloty / Vishnyakov I.E., Borkhsenius S.N., Kayumov A.R., Shmakova L.A., Rivkina E.M. // Geny & Kletki. - 2015. - Tom X, №3. - S.12-21.

Annotation

В вечной мерзлоте в течение длительного геологического времени могут сохраняться ферменты, нуклеиновые кислоты, вирусы и жизнеспособные микроорганизмы. Сложно получить целостное представление о микробном сообществе многолетнемерзлых толщ, используя только классические микробиологические методы. Анализ метагеномов вечной мерзлоты позволил обнаружить генетический материал древних микоплазм – патогенов человека, животных и растений. Отбор образцов, выделение тотальной ДНК из почвы, секвенирование (Illumina), обработка метагеномных данных (MG-RAST, M5nr, UniProt, Krona). Предсказан видовой состав микоплазм в почвенных образцах многолетнемерзлых отложений Арктики различного происхождения, но сопоставимого возраста (31–32 тыс. лет). Выполнен сравнительный анализ коротких полипептидов, кодируемых фрагментами древней ДНК, с участками белков современных микоплазм. Обсуждаются филогенетическая история Mollicutes, пластичность их генома и патогенный потенциал вечной мерзлоты.

Keywords

микоплазмы, метагеномы, вечная мерзлота, пластичность генома, патогенный потенциал, "минимальная" клетка

The name of the journal

Гены & клетки

Please use this ID to quote from or refer to the card

https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=138699&p_lang=2

Full metadata record

Field DC	Value	Language
dc.contributor.author	Kayumov Ayrat Rashitovich	ru_RU
dc.contributor.author	Borkhsenius S. N.	ru_RU
dc.contributor.author	Vishnyakov I. E.	ru_RU
dc.contributor.author	Rivkina E. M.	ru_RU
dc.contributor.author	Shmakova L. A.	ru_RU
dc.date.accessioned	2015-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.available	2015-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.issued	2015	ru_RU
dc.identifier.citation	Вишняков И.Е. ДНК «минимальных» клеток (микоплазм) в метагеномах вечной мерзлоты / Вишняков И.Е., Борхсениус С.Н., Каюмов А.Р., Шмакова Л.А., Ривкина Е.М. // Гены & Клетки. - 2015. - Том X, №3. - С.12-21.	ru_RU
dc.identifier.uri	https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=138699&p_lang=2	ru_RU
dc.description.abstract	Гены & клетки	ru_RU
dc.description.abstract	В вечной мерзлоте в течение длительного геологического времени могут сохраняться ферменты, нуклеиновые кислоты, вирусы и жизнеспособные микроорганизмы. Сложно получить целостное представление о микробном сообществе многолетнемерзлых толщ, используя только классические микробиологические методы. Анализ метагеномов вечной мерзлоты позволил обнаружить генетический материал древних микоплазм – патогенов человека, животных и растений. Отбор образцов, выделение тотальной ДНК из почвы, секвенирование (Illumina), обработка метагеномных данных (MG-RAST, M5nr, UniProt, Krona). Предсказан видовой состав микоплазм в почвенных образцах многолетнемерзлых отложений Арктики различного происхождения, но сопоставимого возраста (31–32 тыс. лет). Выполнен сравнительный анализ коротких полипептидов, кодируемых фрагментами древней ДНК, с участками белков современных микоплазм. Обсуждаются филогенетическая история Mollicutes, пластичность их генома и патогенный потенциал вечной мерзлоты.	ru_RU
dc.language.iso	ru	ru_RU
dc.subject	микоплазмы	ru_RU
dc.subject	метагеномы	ru_RU
dc.subject	вечная мерзлота	ru_RU
dc.subject	пластичность генома	ru_RU
dc.subject	патогенный потенциал	ru_RU
dc.subject	"минимальная" клетка	ru_RU
dc.title	ДНК «минимальных» клеток (микоплазм) в метагеномах вечной мерзлоты	ru_RU
dc.type	Articles in Russian journals and collections	ru_RU