KFU. Card publication. Сборка генома ангидробиотического насекомого Polypedilum vanderplanki с использованием данных Illumina и Pacbio

KAZAN
FEDERAL UNIVERSITY

- RUS
- 中文
- ES

СБОРКА ГЕНОМА АНГИДРОБИОТИЧЕСКОГО НАСЕКОМОГО POLYPEDILUM VANDERPLANKI С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ДАННЫХ ILLUMINA И PACBIO

Form of presentation

Articles in Russian journals and collections

Year of publication

2018

Язык

русский

Authors, employees of KFU

Abramova Zinaida Ivanovna, author

Kozlova Olga Sergeevna, author

Bibliographic description in the original language

Kozlova O.S. Sborka genoma angidrobioticheskogo nasekomogo Polypedilum vanderplanki s ispolzovaniem dannykh Illumina i Pacbio/Kozlova O.S., Abramova Z.I. // Uchen. zap. Kazan. un-ta. Ser. Estestv. nauki. – 2018. – T. 160, kn. 2. – S. 214–226.

Annotation

В статье представлена новая версия сборки генома африканского ангидробиотического комара-звонца Polypedilum vanderplanki на основе глубокого секвенирования ДНК, выделенной из клеточной линии Pv11, полученной из эмбриональной массы насекомого. Исходными данными послужили парные прочтения с варьирующей длиной вставки, дополненные ультрадлинными прочтениями по технологии Pacific Biosciences. Показано, что результирующий набор скаффолдов обладает более высокими метриками целостности и полноты, кроме того, позволяет более корректно выполнять предсказание кодирующих последовательностей по сравнению с предыдущей версией сборки генома, что было продемонстрировано на примере белков теплового шока HSP20 и HSP70.

Keywords

Polypedilum vanderplanki, ангидробиоз, секвенирование ДНК, сборка генома

The name of the journal

Ученые записки Казанского государственного университета Серия: Естественные науки

URL

https://kpfu.ru/portal/docs/F_916691432/160_2_est_3.pdf

Please use this ID to quote from or refer to the card

https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=186315&p_lang=2

Resource files

File name	Size (MB)	Format
SBORKA_GENOMA_ANGIDROBIOTIChESKOGO.pdf	0,47	pdf	show / download

Full metadata record

Field DC	Value	Language
dc.contributor.author	Abramova Zinaida Ivanovna	ru_RU
dc.contributor.author	Kozlova Olga Sergeevna	ru_RU
dc.date.accessioned	2018-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.available	2018-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.issued	2018	ru_RU
dc.identifier.citation	Козлова О.С. Сборка генома ангидробиотического насекомого Polypedilum vanderplanki с использованием данных Illumina и Pacbio/Козлова О.С., Абрамова З.И. // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. – 2018. – Т. 160, кн. 2. – С. 214–226.	ru_RU
dc.identifier.uri	https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=186315&p_lang=2	ru_RU
dc.description.abstract	Ученые записки Казанского государственного университета Серия: Естественные науки	ru_RU
dc.description.abstract	В статье представлена новая версия сборки генома африканского ангидробиотического комара-звонца Polypedilum vanderplanki на основе глубокого секвенирования ДНК, выделенной из клеточной линии Pv11, полученной из эмбриональной массы насекомого. Исходными данными послужили парные прочтения с варьирующей длиной вставки, дополненные ультрадлинными прочтениями по технологии Pacific Biosciences. Показано, что результирующий набор скаффолдов обладает более высокими метриками целостности и полноты, кроме того, позволяет более корректно выполнять предсказание кодирующих последовательностей по сравнению с предыдущей версией сборки генома, что было продемонстрировано на примере белков теплового шока HSP20 и HSP70.	ru_RU
dc.language.iso	ru	ru_RU
dc.subject	Polypedilum vanderplanki	ru_RU
dc.subject	ангидробиоз	ru_RU
dc.subject	секвенирование ДНК	ru_RU
dc.subject	сборка генома	ru_RU
dc.title	Сборка генома ангидробиотического насекомого Polypedilum vanderplanki с использованием данных Illumina и Pacbio	ru_RU
dc.type	Articles in Russian journals and collections	ru_RU